近日,南華大學(xué)衡陽醫(yī)學(xué)院伍代朝教授在Science子刊Science Advances發(fā)表題為“Structural characterization and AlphaFold modeling of human T cell receptor recognition of NRAS cancer neoantigens”(結(jié)構(gòu)表征和AlphaFold建模揭示T細(xì)胞受體識(shí)別NRAS癌癥新抗原的機(jī)制)的研究型論文。
伍代朝為獨(dú)立第一兼共同通訊作者,美國馬里蘭大學(xué)Roy Mariuzza和Brian Pierce為共同通訊作者,南華大學(xué)附屬第一醫(yī)院肝膽外科陳國棟、美國Absci印銳和美國國家癌癥中心Paul F. Robbins等為重要參與成員,南華大學(xué)衡陽醫(yī)學(xué)院附屬第一醫(yī)院為第一單位。該研究受到國家自然科學(xué)基金、湖南省杰出青年科學(xué)基金等資助。
識(shí)別癌癥新抗原的T細(xì)胞受體(TCR)在抗癌癥免疫反應(yīng)及免疫治療中發(fā)揮重要作用。深入解析TCR特異性識(shí)別癌癥新抗原的結(jié)構(gòu)機(jī)制,對(duì)TCR設(shè)計(jì)及基于TCR的癌癥免疫治療策略研發(fā)至關(guān)重要。由于TCR與肽-MHC識(shí)別模式的多樣性及TCR抗原互補(bǔ)決定區(qū)的高度可變性,很難通過AlphaFold模擬的方式獲取準(zhǔn)確的復(fù)合物結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)模型。該研究基于晶體學(xué)的方法報(bào)道了癌癥治療相關(guān)TCR與NRAS新抗原靶點(diǎn)的復(fù)合物結(jié)構(gòu),揭示TCR與NRAS新抗原突變位點(diǎn)氨基酸的極性相互作用介導(dǎo)了一種TCR特異性識(shí)別兩種癌癥新抗原的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ);并采用基于人工智能AlphaFold預(yù)測(cè)的方式建立了用于前瞻性的TCR免疫識(shí)別建模參數(shù)和評(píng)分閾值,以評(píng)估AlphaFold對(duì)TCR與新抗原復(fù)合物結(jié)構(gòu)模型的預(yù)測(cè)性能,為TCR-肽-MHC復(fù)合物結(jié)構(gòu)研究提供新的研究范式。
在論文預(yù)印本階段,Elie Dolgin在Cancer Discov期刊撰寫2024年Nobel化學(xué)獎(jiǎng)新聞,重點(diǎn)強(qiáng)調(diào)該工作并突出AlphaFold在預(yù)測(cè)TCR-肽-MHC復(fù)合物結(jié)構(gòu)的巨大進(jìn)步及其局限性(https://doi.org/10.1158/2159-8290.CD-NW2024-0076)。
伍代朝實(shí)驗(yàn)室開展基于TCR的新型免疫治療及其結(jié)構(gòu)與功能研究,主要成果以獨(dú)立第一/共同通訊作者發(fā)表在Sci Adv(2024)、Nat Commun(2022/2020)、J Hematol Oncol(2021)、J Exp Clin Cancer Res(2024)、J Biol Chem(2023/2022)等期刊;主持國家自然科學(xué)基金面上、青年、湖南省杰出青年科學(xué)基金、湖南省青年科技創(chuàng)新人才、湖湘青年英才、湖南省衛(wèi)健委高層次人才等項(xiàng)目;主編國家級(jí)規(guī)劃教材1部;擔(dān)任南華附一雙聘教授,衡陽市省級(jí)領(lǐng)軍人才,湖南省免疫學(xué)會(huì)臨床免疫分會(huì)副主委,中國解剖學(xué)會(huì)組胚分會(huì)委員。實(shí)驗(yàn)室常年招收博士后、助理教授、副教授,入職就是團(tuán)隊(duì)核心成員,Email(金老師):2548743420@qq.com。
原文鏈接:https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.adq6150